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/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00357 < prev    next >
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Text File  |  1995-03-04  |  1.7 KB  |  37 lines
  1. ********************************************************
  2. * Prokaryotic zinc-dependent phospholipase C signature *
  3. ********************************************************
  4.  
  5. Bacillus cereus expresses  a phosphatidylcholine  hydrolyzing  phospholipase C
  6. (EC 3.1.4.3) (PLC) which  is a  monomeric  protein  of 245 amino-acid residues
  7. that binds three zinc ions [1].  This  PLC is  highly similar to the following
  8. proteins:
  9.  
  10.  - Alpha-toxin from Clostridium  perfringens and bifermentans  which  are also
  11.    zinc-dependent phospholipases C [2].
  12.  - Lecithinase C from Listeria monocytogenes [3].
  13.  
  14. In Bacillus  cereus,  there  are nine residues known to be involved in binding
  15. the zinc ions: 5 His, 2 Asp, 1 Glu and 1 Trp. These residues are all conserved
  16. in the Clostridium alpha-toxin.
  17.  
  18. As a signature pattern  for  this  family  of enzymes, we selected a conserved
  19. region of 11 residues  that  contains  three  of the zinc ligands: a histidine
  20. involved in  binding the first zinc ion, an aspartic acid which binds both the
  21. first and the third zinc ion, and a histidine which binds the second zinc ion.
  22.  
  23. -Consensus pattern: H-Y-x-[GT]-D-[LIVM]-[DNS]-x-P-x-H-[PA]-x-N
  24.                     [The two H's and the D bind zinc]
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  28.  
  29. [ 1] Hough E., Hansen L.K., Birknes B., Jynge K., Hansen S., Hordvik A.,
  30.      Little C., Dodson E., Derewenda Z.
  31.      Nature 338:358-360(1989).
  32. [ 2] Titball R.W., Rubidge T.
  33.      FEMS Microbiol. Lett. 68:261-266(1990).
  34. [ 3] Vazquez-Boland J.-A., Kocks C., Dramsi S., Ohayon H., Geoffroy C.,
  35.      Mengaud J., Cossart P.
  36.      Infect. Immun. 60:219-230(1992).
  37.